Sinopse Depois dos eventos de 02, tudo está finalmente voltando ao normal. Isto é, até que um ícone estranhamente familiar começa a aparecer em sistemas de computador ao redor do Japão. E não apenas sistemas de computador... TVs, celulares, videogames; qualquer coisa com uma tela com recursos on-line. E este ícone parece estar procurando por somone... Yagami Taichi e Ishida Yamato, que o derrotaram vários anos antes. Sim, acontece que este digimon medusa é na verdade Diablomon, o Digimon tipo vírus que foi derrotado no segundo filme. Mas desta vez, ele aprendeu a se tornar físico, e está enviando milhares de cópias de si mesmo para o mundo real. Koushiro e Ken elaboram um plano para livrar o mundo do vírus de uma vez por todas, mas será preciso a ajuda de todos os destinos, passado e presente. Mais uma vez, é uma corrida contra o tempo para acabar com o plano de Diablomon... mas mesmo isso está camuflado na sombra. Será que o renascimento de Omagamon será suficiente para parar Diablomon uma segunda vez, ou os milhões de cópias provarão o suficiente de um impulso de poder para encolher o "Campeão digimon da Justiça"? Claro, ele não viu a nova raça de Chosen, nem as novas técnicas. É uma luta até o fim, com a destruição de Tóquio descansando na linha. (Fonte: AniDB)